دفتر همکاری‌های علمی بین‌المللی دانشگاه اصفهان فعالیت‌های خود را چند سال پس از تأسیس دانشگاه اصفهان به شکل مدرن کنونی آغاز نمود. پس از پیروزی انقلاب اسلامی و استقرار نظام جمهوری اسلامی ایران، فعالیت‌های این دفتر، توسعه یافت و وظایف خود را در قالب همکاری‌های علمی بین‌المللی، گردهمایی‌های علمی بین‌المللی، امور بورس‌ها و مأموریت‌های علمی، امور اساتید و دانشجویان خارجی و امور تشریفات به انجام می‌رساند.

• بین‌المللی‌سازی فعالیت‌ها و برنامه‌های دانشگاه به عنوان یک هدف راهبردی
• نهادینه ساختن همکاری‌های بین‌المللی به عنوان یک ضرورت برای دانشگاه
• دانشگاه اصفهان، تاکنون بیش از ۲۰۰ یادداشت تفاهم‌ همکاری و موافقت‌نامه علمی با دانشگاه‌ها و مراکز آموزش عالی در جهان از جمله کشورهای: آلمان، ارمنستان، اسپانیا، انگلستان، ایتالیا، ترکیه، چین، ژاپن، سوئد، سوریه، عراق، فرانسه، کانادا، کره جنوبی، لبنان، مالزی و هند منعقد نموده است. محورهای اصلی یک تفاهم‌نامه که درباره آنها به صورت کلی و یا جزئی توافق می‌شود عبارتند از:
• اجرای فعالیت‌های مشترک پژوهشی (از جمله تبادل هیأت علمی و پژوهشگران)
• مشارکت در سمینارها و نشست‌های علمی
• تبادل مطالب آموزشی و سایر اطلاعات علمی
• برنامه‌های علمی کوتاه‌مدت خاص و در مواردی، تشکیل دوره‌های مشترک
• تبادل دانشجو
• سایر فعالیت‌های علمی و پژوهشی بین‌المللی مناسب و مورد توافق دو دانشگاه
• همچنین قراردادهای اجرایی و خواهرخواندگی بر اساس توافق کلی مفاد یادداشت تفاهم و با توجه به اولویت‌های کاری و تخصصی واحدها با مراکز، مؤسسات و دانشکده‌های خارجی منعقد می‌گردد.